Nowa analiza rzuca światło na różnorodność i ślad ekologiczny morskich wirusów RNA

Według nowego raportu, analiza na poziomie społeczności i „gatunku” globalnych sekwencji RNA oceanów pobranych z wód na całym świecie ujawniła słabo poznaną różnorodność i ślad ekologiczny morskich wirusów RNA.

Odkrycia podkreślają ważną rolę, jaką morskie wirusy RNA odgrywają w ekosystemie oceanicznym. Wirusy są wszechobecne we wszystkich dziedzinach życia i odgrywają kluczową rolę jako czynniki napędzające ewolucję, bioróżnorodność i cykl biogeochemiczny, w którym pośredniczy mikrobiom. Większość wysiłków zmierzających do zrozumienia lądowych wirusów morskich koncentrowała się na wirusach DNA, o których wiadomo, że są liczne, różnorodne i mają duże znaczenie w ekosystemie. Chociaż ostatnie badania sekwencjonowania oceanów zidentyfikowały tysiące wcześniej nieznanych wirusów RNA i dostarczyły nowych informacji na temat ich ewolucyjnego pochodzenia i światowego liczebności, bardzo niewiele wiadomo na temat globalnej różnorodności, ekologii i roli ekosystemów morskich wirusów RNA. Korzystanie z zestawu danych sekwencjonowania RNA Oceanu Światowego dostarczonego przez Tara Ocean Explorations, Guillermo Dominguez-Huerta i współpracownicy badają globalną różnorodność i ślad ekologiczny morskich wirusów RNA. Zgodnie z wynikami, morskie wirusy RNA infekują głównie żywicieli pierwotniaków i grzybów, w tym planktonu. Jak zaobserwowano w przypadku wirusów DNA, są one podzielone na cztery odrębne regiony ekologiczne, zdeterminowane głównie głębokością iw mniejszym stopniu szerokością geograficzną.

Co więcej, Dominguez Huerta i in. Odkrył, że wpływ wirusów RNA na ekosystem oceaniczny jest znaczący – metaboliczne geny pomocnicze w wiromie RNA wskazują, że wirusy RNA mogą wpływać na wiele krytycznych procesów planktonowych, takich jak fotosynteza i przepływ węgla w oceanach.

Dla reporterów zainteresowanych trendami to badanie opiera się na poprzednim raporcie z kwietnia 2022 r. Nauki W artykule badawczym oceniono około 28 terabaz sekwencji RNA Oceanu Światowego zebranych podczas ekspedycji Tara Ocean. Wyniki ujawniły tysiące wcześniej nieznanych morskich wirusów RNA i dostarczyły nowych informacji na temat wczesnej ewolucji wirusa RNA.